基因测序及鉴定

面向科研与产业需求,开展大型真菌子实体及丝状真菌、细菌、酵母菌等微生物的基因测序与分子鉴定,提供规范的实验记录与结果报告,为分类确认、论文发表、项目申报及质量控制提供支撑。

常用测序靶标包括 ITS、28S、18S、β-tubulin、TEF1-α、16S rRNA 等,具体引物与分析方案可按样品类型与鉴定目的协商确定。下列为基本流程与送样要求,供送检前参考。

一、大型真菌子实体测序

基本流程

  1. 沟通确认:说明样品种属(若已知)、采集信息、测序片段与结果用途。
  2. 预约送样:填写送样信息表,约定快递或当面送达时间。
  3. 样品接收与初检:核对样品状态、编号及资料完整性。
  4. DNA 提取:按子实体组织性状选择适宜提取方法。
  5. PCR 扩增与电泳质检:确认目标片段扩增成功。
  6. 测序与序列分析:拼接校对后进行 BLAST / 数据库比对。
  7. 结果交付:提供序列、比对摘要及分子鉴定参考意见。

送样要求

  • 样品类型:新鲜子实体(优先)或充分干燥、无霉变的干标本;同一编号请保留可辨认的菌盖、菌褶(或菌孔)等关键部位。
  • 取样部位:优先取菌褶、菌管或幼嫩菌肉;避免严重腐烂、浸水或明显污染部位。
  • 数量:单个样品新鲜组织约 0.5–2 g,或以豆粒至硬币大小组织块为宜;干品需能满足一次提取。
  • 包装与寄送:新鲜样品用干净纸袋或吸水纸包裹后装入透气袋/盒,避免长时间密封出汗;干品可用密封袋并标注防潮。夏季建议冷藏寄送。
  • 信息标注:每份样品单独编号,注明中文名/拉丁名(若有)、采集地、采集人、采集日期及联系方式。
  • 不建议送样:严重腐烂、长满杂菌、无法确认来源或混杂多种子实体的样品。

说明:野外采集样品若需同步形态鉴定,建议另附清晰宏观照片(菌盖、菌褶/菌孔、菌柄、剖面及生长基质)。

二、丝状真菌 / 细菌 / 酵母菌测序

基本流程

  1. 沟通确认:明确菌种类型、目标基因、是否需纯化复壮及结果用途。
  2. 预约送样:提交送样信息表与生物安全相关说明。
  3. 样品接收:检查培养物活性、污染情况与包装安全。
  4. 纯化与培养(如需):对污染或老化菌株进行复苏、划线纯化。
  5. 基因组 DNA 提取与 PCR 扩增。
  6. 测序、序列校对与分子比对鉴定。
  7. 结果交付:提供序列文件、比对结果及鉴定参考意见。

送样要求

  • 丝状真菌:斜面或平板纯培养,菌落生长良好、无明显杂菌;建议培养至可取足菌丝或孢子的阶段(一般 5–14 天,视生长速度而定)。寄送时封口牢固,外层加缓冲包装防破裂。
  • 细菌:斜面、平板或液体纯培养均可;液体培养请密封防漏,建议另附新鲜划线平板。标明培养基名称与培养温度。
  • 酵母菌:斜面或平板纯培养,菌落清晰、无细菌/霉菌污染;注明培养基与培养条件。
  • 数量:每种菌至少 1 支(皿)有效培养物;重要样品建议备份自留。
  • 信息标注:菌株编号、暂定名称、来源、分离日期、培养基、培养温度、已知抗性或特殊要求及联系人。
  • 生物安全:仅接收合规保存与转运的普通环境/已知低风险菌株;致病性强、需特殊许可或不明高风险材料请提前书面确认,未经评估不予接收。
  • 寄送建议:常温或按菌种特性冷藏寄送;包装须防震、防漏,并在外箱注明“微生物培养物,请勿倒置/暴晒”。

说明:若仅提供 DNA 模板,请确保纯度与浓度满足扩增要求,并注明提取方法与浓度估计值。具体检测周期、费用与交付形式请通过留言或电话与我们确认。

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